“可燃冰”的开采方法主要有三种，即热解法、减压法和置换法。开采的最大困难是保证井底的稳定，使甲烷气体不泄漏，不会造成温室效应。
热解法
利用可燃冰在加热过程中的分解特性，可以将甲烷蒸气从固态分解出来。但这种方法的难点在于不易收集。海底的多孔介质不是集中成“一块”或大块岩石，而是分布更均匀。如何有效地铺设和收集管道是一个亟待解决的问题。
减压法
一些科学家提议将核废料埋在地下，利用核辐射效应将其分解。但它们都面临着与热解同样的管道布置和高效收集问题。
替换法
研究证明，将二氧化碳液化并注入1500米以下的海洋，会产生比海水比例更大的二氧化碳水合物，从而沉到海底。如果将二氧化碳注入海底甲烷水合物储层，由于二氧化碳比甲烷更容易形成水合物，甲烷水合物中的甲烷分子可能被“挤出”并被取代。
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